雲頂菴は臨済宗にして鎌倉五山第二の瑞鹿山円覚興聖禅寺 （ずいろくさんえんがくこうしょうぜんじ） の塔頭 （たっちゅう） です。 もとは、禅宗では五山・十刹に次ぐ寺格「諸山 （しょざん） 」に列せられていた大崎山 （おおさきさん） 長勝寺の塔頭でした。
　長勝寺は1296年大覚禅師・蘭渓道隆 （らんけいどうりゅう） の法嗣 （はっす） 、仏燈国師・約翁徳倹 （やくおうとくけん） により創建され、その後、二世・空山円印 （くうざんえんいん） が寿塔として雲頂菴を開きました。開基は長勝寺、雲頂菴とも明らかではありません。
　鎌倉幕府滅亡後、鎌倉の諸寺院はその存続も危ぶまれましたが、雲頂菴は多くの寺と同様に、後醍醐天皇の保護により、それまで所有してきた領地を安堵され、大きな混乱もなく寺勢を保ってきました。これを裏付けるものとして、当菴所蔵の後醍醐天皇論旨 （りんじ） があり、弘安3年（1333）前後の雲頂菴は健在であったことがわかります。
　しかし、室町時代に入り、長勝寺は衰退し廃絶。雲頂菴もまた、鎌倉中を巻き込んだ永亨 （えいきょう） の乱（1438年）によりすっかり衰え、かろうじて命脈を保っていたところ、文明年間1460年前後から、主の関東官領上杉氏を抑えて台頭してきた長尾氏（長尾尾張守忠景、顕忠父子等）が後ろ盾となって再興し、円覚寺内・大覚派の拠点として勢いを得ました。
　中世から近世への橋渡しの時期に、雲頂菴は円覚寺において、同じ大覚派の法珠院 （ほうじゅいん） 、龍隠庵 （りゅういんあん） とともに、中心的な役割を果たしました。
　江戸時代より後は円覚寺の塔頭に入り今日に至っています。

宗旨　臨済宗　円覚寺派（円覚寺塔頭）
開創　1275年

本尊　宝冠釈迦如来
開山　空山円印（大覚禅師蘭渓道隆の直弟）嘉暦3年（1328）11月11日示寂
開基　不詳　中興開基　長尾忠景
山号　大機山

◆注
塔頭：禅宗寺院の高僧の死後、弟子がその徳を慕い構えた墓塔や庵
諸山：禅宗寺院の官寺制度における3段階からなる寺格のひとつ。最高位が五山
法嗣：師の教え、仏法の奥義を受け継いだ弟子
寿塔：生存中に、その人の長寿や功績をたたえて建てられた塔
開基：仏寺創建の際、財政的支持・支援を行う世俗の人。禅宗では、開創の僧である「開山」と 区別していう
綸旨：天皇の側近が、天皇の意向を受け作成した文書。※ここでは、雲頂菴領をこれまでどおり支配してよいと保証した文書